水利与土木建筑工程系成立于2006年，是集水利水电工程技术、建筑工程技术、水利水电建筑工程、工程造价、建筑消防技术、无人机测绘技术等9个专业的工科系部。水利水电建筑工程专业被评为国家骨干院校重点建设专业、自治区品牌专业、高等职业教育创新发展行动计划骨干建设专业。它积淀原内蒙古水利学校、内蒙古水利职工大学60多年的丰富办学经验。系内师资力量雄厚，师资队伍结构合理。现有专任教师37名，其中教授2名、副教授14名、讲师13名、助教4名。具有博士学位2人、硕士学位19人，双师素质教师达89%。其中教师党员20人，自治区级教学名师2人，自治区级教坛新秀1人，自治区级优秀教学团队3个，院级优秀教学团队4个，院级教学名师4人，自治区品牌专业3个。系部在校学生有866人，共28个教学班。

我系始终坚持深化三教改革、创新人才培养模式、加强师资队伍建设。是建筑工程识图“1+X”职业技能等级证书考点、试点单位以及装配式建筑构件制作与安装职业技能等级证书试点、考点单位。系部有2个“双师型”教师培养培训基地。现已建成自治区级精品课4门，自治区级精品在线开放课程3门，院级精品课12门，院级课程思政示范课程2门。近几年我系以大赛为引领，以赛促学、以赛促教、以赛促改，近五年来以来获全国、自治区、行业方面的技能大赛和创新创业类大赛共计30余项。2023年在全国职业院校技能大赛高职组“水利工程BIM建模与应用”比赛中荣获团体三等奖;在第十三届“挑战杯”全区大学生课外学术科技作品竞赛中荣获特等奖1项，三等奖4项,二等奖1项;在全区课程思政教学能力比赛中获二等奖；教师指导学生在2023年秋季学期全区高等职业院校技能大赛建筑信息模型建模与应用比赛中获二等奖；在2023年秋季学期全区高等职业院校技能大赛建设工程数字化计量与计价中获三等奖。2022年在全国高等职业院教师能力大赛高职教学能力大赛中获自治区一等奖。2020年在全国高等职业院校技能大赛教学能力比赛中获国家级三等奖。

系部与内蒙古浩禹建筑有限责任公司、内蒙古通洋水利水电工程咨询有限责任公司、中天十建内蒙古分公司等50多家企业建立校外实习、实训基地。学生毕业后主要在内蒙古黄河工程局股份有限公司、中国核电建设有限公司等50多家单位就业。毕业生被用人单位誉为“下得去，用得上，留得住”的高素质技术技能人才。